Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC162PA2VCL2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms