Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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