Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms