Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms