Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP3Q9Y3E7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms