Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms