Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms