Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms