Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCQ9Y266 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms