Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC2Q9Y235 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC2Q9Y235 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC2Q9Y235 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms