Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms