Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms