Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZMYND8Q9ULU4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms