Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms