Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms