Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms