Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL42Q9P2K6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms