Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms