Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms