Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms