Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDAP2Q9NXN4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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