Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM106BQ9NUM4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms