Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms