Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms