Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms