Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms