Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms