Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP4F12Q9HCS2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms