Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms