Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms