Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms