Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms