Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms