Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms