Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms