Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms