Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFHD1Q9BUP0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms