Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOXF2Q9BQY4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms