Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms