Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms