Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF6Q99612 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF6Q99612 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms