Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms