Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK5RAP2Q96SN8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms