Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms