Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms