Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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