Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms