Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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