Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms