Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM4SF19Q96DZ7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms